Dora usiłuje rozwikłać tajemnicę zaginionej inkaskiej cywilizacji, aby uratować swoich rodziców.
W pierwszej części poznajemy historię Dory jako dziewczynki wychowywanej w dżungli przez parę naukowców. Jako nastolatka, zostaje wysłana do amerykańskiego liceum, gdzie dość szybko zyskuje miano dziwaczki. I to jest ta gorsza część.
Podczas szkolnej wycieczki do muzeum wraz z kuzynem, kolegą i koleżanką ze szkoły, Dora zostaje porwana przez łowców skarbów. Chcą dzięki niej uzyskać informacje o zaginionym mieście Inków, na którego ślady natrafili jej rodzice. Od tej chwili skupiamy się na przetrwaniu w dżungli oraz rozwiązywaniu starożytnych zagadek. To dla dzieci jest już gratka. Z jednej strony mamy przestępców żądnych skarbów, z drugiej naukowców żadnych wiedzy, z szacunkiem podchodzących do innych kultur.